尿石形成的機理比較復雜，至今尚未完全明了，目前認為尿石形成有二項基本要素：

1.尿內晶體飽和度：

尿內含有形成結石的晶體，主要成分有磷酸鹽、草酸鹽、尿酸鹽等，如這些晶體在尿液中飽和度過高，則易引起析出、沉淀、結聚，以致尿石形成。

2.晶體聚合抑制因子：

尿內存在有晶體聚合抑制物質，如焦磷酸鹽，枸橡酸、鎂、多肽、尿素、粘多糖、透明質酸，甘氨聚糖等，這些抑制因子和晶體表面的某些特殊部位結合即可抑制晶體的再形成和聚合。