高滴度的抗U1-nRNP抗體是混合性結締組織病（MCTD，夏普綜合征）的標志，陽性率為95-100％，抗體滴度與疾病活動性相關。在30-40％的系統性紅斑狼瘡患者中也可檢出抗U1-nRNP抗體，但幾乎總伴有抗Sm抗體。

　　抗Sm抗體是系統性紅斑狼瘡的特異性抗體，與抗dsDNA抗體一起，是系統性紅斑狼瘡的診斷指標，但陽性率僅為5-10％。

　　抗SS-A抗體與各類自身免疫性疾病相關，最常見于干燥綜合征（40-80％）、也見于系統性紅斑狼瘡（30-40％）和原發性膽汁性肝硬化（20％）中，偶見于慢性活動性肝炎。此外，在100％的新生兒紅斑狼瘡中可出現抗SS-A抗體。該抗體可經胎盤傳給胎兒引起炎癥反應和新生兒先天性心臟傳導阻滯。抗SS-B抗體幾乎僅見于干燥綜合征（40-80％）和系統性紅斑狼瘡（10-20％）的女性患者中，男女比例為1:29。在干燥綜合征中抗SS-A抗體和抗SS-B抗體常同時出現。抗Scl-70抗體見于25-75％的進行性系統性硬化癥（彌散型）患者中，因實驗方法和疾病活動性而異（Scl=硬化癥）。在局限型硬化癥中不出現。抗Jo-1抗體見于多肌炎，陽性率為25-35％。常與合并肺間質纖維化相關。抗著絲點抗體與局限型進行性系統性硬化癥（CREST綜合征：鈣質沉著、Raynaud’s病、食管功能障礙、指硬皮病、遠端血管擴張）有關，陽性率為70-90%。在原發性膽汁性肝硬化的患者中也有10－30%陽性率。雷諾氏綜合征也可檢測該抗體。抗dsDNA抗體是系統性紅斑狼瘡的指標性抗體，陽性率為30-90%。抗體滴度與疾病活動度存在相關性。抗核小體抗體在系統性紅斑狼瘡患者血清中陽性率為40-90%，特異性>98%。核小體是細胞染色質中的一種成分，由DNA和組蛋白以特殊的方式相連而組成的。抗核小體抗體比抗dsDNA抗體、抗組蛋白抗體更早出現于系統性紅斑狼瘡的早期，在系統性紅斑狼瘡的誘導和致病中有重要作用。臨床資料顯示，在抗dsDNA抗體陰性的SLE患者中，有15－19％為抗核小體抗體陽性。因此聯合檢測抗dsDNA及核小體抗體可提高SLE血清學診斷率。

　　抗一種或幾種組蛋白抗體或抗H2A-H2B復合物抗體在藥物（普魯卡因胺、肼酞嗪以及其它藥物）誘導的紅斑狼瘡中比較常見（陽性率為95%）。另外，在30-70%的系統性紅斑狼瘡和15-50%的類風濕性關節炎患者中也可檢出抗組蛋白抗體。抗核糖體P蛋白抗體（ARPA）是系統性紅斑狼瘡的特異性標志。有些學者認為SLE的活動性與ARPA的滴度具有相關性，還可能與對于有中樞神經系統癥狀、腎炎或肝炎相關。

　　R0-52：在SLE，干燥綜合征的敏感性為100％，但其無器官特異性，在肌炎，硬皮病及其它風濕性疾病中可檢出。