胰腺結石的病因迄今尚不十分明了，從大量資料統計的結果證明，胰石癥與飲酒有關，飲酒時間長、量大者則易形成胰結石的病例中例）發病年齡多在30～50歲，每日飲酒量平均在、蛋白攝入量100g、脂肪攝入量90g.今村報道45例胰腺結石，其中43例飲酒長達10年以上。此外，胰石癥與家族史有關亦有報道，日本已報道10多個家族患此癥。其他如膽道疾病、甲狀旁腺機能亢進，亦與之有關。蛋白質長期缺乏亦可造成胰腺的細胞變性、纖維化等與胰石癥相類似的改變。

　　長期嗜酒則胰液中蛋白質的濃度明顯增高，形成蛋白質沉積。在胰管內沉淀的蛋白質栓經鈣化而形成結石。在正常人與慢性胰腺炎病人的血中有一種胰石蛋白（Pancreatic）。PSP通過結合而封鎖碳酸鈣的活性，從而抑制碳酸鈣的沉淀。當長期嗜酒或營養不良等因素則PSP分泌減少，胰液中過飽和的碳酸鈣不再受其抑制而形成結晶沉淀。這些碳酸鈣結晶沉淀于脫落的上皮細胞、粘膜、胰酶以及非酶的胰鐵蛋白等的網絡狀結構上，加之這些結晶表面的電位活性高以及網絡狀結構表面積大，一些金屬離子通過吸收沉淀到網絡上，經過一定時間的沉積則形成結石。胰結石含碳酸鈣約占955，表面層尚含有鈣、鉻、鎂等。